Ein Mesozyklon ist ein rotierender Aufwind innerhalb eines kräftigen Gewitters. Er entsteht, wenn starke Windunterschiede mit der Höhe – sogenannter Windscherung – dafür sorgen, dass ein zunächst horizontal wirbelnder Luftstrom aufgerichtet und in die Gewitterwolke hineingezogen wird.
Dadurch bildet sich ein mehrere Kilometer breiter, stabil rotierender Bereich in der Wolke. Mesozyklonen sind typisch für Superzellengewitter, also besonders langlebige und organisierte Gewitterstrukturen. Der typische Durchmesser eines Mesozyklons liegt zwischen 2-10 km.